農食環境学群・循環農学類
教員 増田豊 マスダ ユタカ
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更新日 :2024/03/18

研究者基本情報

氏名

増田豊
マスダ ユタカ

所属(マスタ)

農食環境学群・循環農学類, 教員

所属・職名

酪農学園大学
農食環境学群 循環農学類
准教授

学歴

2005年04月 - 2008年03月, 岩手大学大学院, 連合農学研究科, 生物生産科学専攻
2003年04月 - 2005年03月, 帯広畜産大学大学院, 畜産学研究科, 家畜生産科学専攻
1996年04月 - 2000年03月, 帯広畜産大学, 畜産学部, 畜産管理学科

学位

博士(農学), 岩手大学

所属学協会

北海道畜産草地学会
米国畜産学会
米国酪農学会
日本畜産学会

委員歴

  2023年04月 - 現在, 日本ホルスタイン登録協会, 乳用牛ゲノミック選抜の推進強化研究事業 推進検討委員
  2021年06月 - 現在, 乳用牛改良推進協議会, 乳用牛改良手法の高度化事業に係る乳用牛改良体制検討委員会(遺伝評価技術)委員
  2021年 - 2026年, The Permanent Committee of WCGALP, The representative of Japan
  2021年04月 - 2023年03月, 日本ホルスタイン登録協会, 乳用牛長命連産性の遺伝的改良研究事業に係る推進委員会委員
  2021年 - 2023年, Frontiers in Genetics, Review Editor
  2021年 - 2023年, 北海道畜産草地学会, 編集委員

経歴

  2021年04月 - 現在, 酪農学園大学農食環境学群 循環農学類准教授
  2016年12月 - 2021年04月, ジョージア大学アシスタント・リサーチ・サイエンティスト
  2014年07月 - 2016年11月, ジョージア大学博士研究員
  2008年04月 - 2014年07月, 帯広畜産大学助教

研究活動情報

研究分野

ライフサイエンス, 遺伝学, 量的遺伝学
ライフサイエンス, 動物生産科学, 家畜育種学

研究キーワード

統計学,
乳用牛,
プログラミング,
数値計算,
データサイエンス,
量的遺伝学,
ゲノミック選抜,
家畜育種,

論文

乳用牛群におけるゲノミックヤングサイアの利用に関するリスク評価, 増田 豊, 日本畜産学会報, 95, (1) 31 - 37,   2024年02月25日
Longitudinal genome-wide association analysis using a single-step random regression model for height in Japanese Holstein cattle, Toshimi Baba; Gota Morota; Junpei Kawakami; Yusaku Gotoh; Taro Oka; Yutaka Masuda; Luiz F. Brito; Rebbeca R. Cockrum; Takayoshi Kawahara, JDS Communications, 4, (5) 363 - 368,   2023年09月
Application of single-step single nucleotide polymorphism best linear unbiased predictor model with unknown-parent groups for type traits in Japanese Holsteins., Takefumi Osawa; Yutaka Masuda; Junichi Saburi; Keita Hirumachi, Journal of dairy science, 106, (7) 4847 - 4859,   2023年07月
Nonparallel genome changes within subpopulations over time contributed to genetic diversity within the US Holstein population., Y Steyn; T Lawlor; Y Masuda; S Tsuruta; A Legarra; D Lourenco; I Misztal, Journal of dairy science, 106, (4) 2551 - 2572,   2023年04月
Genome-wide search reveals the uniqueness of DNA regions associated with coat color and innate immunity in Hokkaido Native Horse., Tomoko Amano; Haruhi Yokawa; Yutaka Masuda; Teruaki Tozaki; Masahito Kawai; Kouichi Shirai, Animal science journal = Nihon chikusan Gakkaiho, 94, (1) ,   2023年
Identifying influential sires and distinct clusters of selection candidates based on genomic relationships to reduce inbreeding in the US Holstein, Y. Steyn; Y. Masuda; S. Tsuruta; D.A.L. Lourenco; I. Misztal; T. Lawlor, Journal of Dairy Science, 105, (12) 9810 - 9821,   2022年12月
An iterative method for de-regressed proof in single-step genomic BLUP and its application to a dairy cattle population, Y Masuda; Z Liu; P Sullivan, Proceedings of the 12th World Congress of Genetics Applied to Livestock Production,   2022年07月
Is single-step genomic REML with the algorithm for proven and young more computationally efficient when less generations of data are present?, Vinícius Silva Junqueira; Daniela Lourenco; Yutaka Masuda; Fernando Flores Cardoso; Paulo Sávio Lopes; Fabyano Fonseca E Silva; Ignacy Misztal, Journal of animal science, 100, (5) ,   2022年03月15日
Invited review: Unknown-parent groups and metafounders in single-step genomic BLUP, Yutaka Masuda; Paul M. VanRaden; Shogo Tsuruta; Daniela A.L. Lourenco; Ignacy Misztal, Journal of Dairy Science, 105, (2) 923 - 939,   2022年02月
Genomic prediction of milk-production traits and somatic cell score using single-step genomic best linear unbiased predictor with random regression test-day model in Thai dairy cattle, S. Buaban; S. Prempree; P. Sumreddee; M. Duangjinda; Y. Masuda, Journal of Dairy Science, 104, (12) 12713 - 12723,   2021年09月
Investigating the persistence of accuracy of genomic predictions over time in broilers., Jorge Hidalgo; Daniela Lourenco; Shogo Tsuruta; Yutaka Masuda; Vivian Breen; Rachel Hawken; Matias Bermann; Ignacy Misztal, Journal of animal science, 99, (9) ,   2021年08月11日
Reducing computational cost of large-scale genomic evaluation by using indirect genomic prediction, S. Tsuruta; D.A.L. Lourenco; Y. Masuda; T.J. Lawlor; I. Misztal, JDS Communications, 2021, (2) 923 - 939,   2021年08月
Genomic predictions for yield traits in US Holsteins with unknown parent groups, A. Cesarani; Y. Masuda; S. Tsuruta; E.L. Nicolazzi; P.M. VanRaden; D. Lourenco; I. Misztal, Journal of Dairy Science, 104, (5) 5843 - 5853,   2021年05月
Changes in genomic predictions when new information is added, Jorge Hidalgo; Daniela Lourenco; Shogo Tsuruta; Yutaka Masuda; Stephen Miller; Matias Bermann; Andre L S Garcia; Ignacy Misztal, Journal of Animal Science, 99, (2) ,   2021年02月01日
Comparison of models for missing pedigree in single-step genomic prediction, Yutaka Masuda; Shogo Tsuruta; Matias Bermann; Heather L Bradford; Ignacy Misztal, Journal of Animal Science, 99, (2) ,   2021年02月01日
Metafounders May Reduce Bias in Composite Cattle Genomic Predictions., Sabrina Kluska; Yutaka Masuda; José Bento Sterman Ferraz; Shogo Tsuruta; Joanir Pereira Eler; Fernando Baldi; Daniela Lourenco, Frontiers in genetics, 12, 678587 - 678587,   2021年
Validation of single‐step GBLUP genomic predictions from threshold models using the linear regression method: An application in chicken mortality, Matias Bermann; Andres Legarra; Mary Kate Hollifield; Yutaka Masuda; Daniela Lourenco; Ignacy Misztal, Journal of Animal Breeding and Genetics, 138, (1) 4 - 13,   2021年01月
家畜育種におけるゲノム情報の活用とその展望, 増田 豊, 日本畜産学会報, 91, (3) 307 - 311,   2020年08月25日
Bias and accuracy of dairy sheep evaluations using BLUP and SSGBLUP with metafounders and unknown parent groups., Fernando L Macedo; Ole F Christensen; Jean-Michel Astruc; Ignacio Aguilar; Yutaka Masuda; Andrés Legarra, Genetics, selection, evolution : GSE, 52, (1) 47 - 47,   2020年08月12日
Beef trait genetic parameters based on old and recent data and its implications for genomic predictions in Italian Simmental cattle., Alberto Cesarani; Jorge Hidalgo; Andre Garcia; Lorenzo Degano; Daniele Vicario; Yutaka Masuda; Ignacy Misztal; Daniela Lourenco, Journal of animal science, 98, (8) ,   2020年08月01日
Single-Step Genomic Evaluations from Theory to Practice: Using SNP Chips and Sequence Data in BLUPF90, Daniela Lourenco; Andres Legarra; Shogo Tsuruta; Yutaka Masuda; Ignacio Aguilar; Ignacy Misztal, Genes, 11, (7) 790 - 790,   2020年07月14日
Variance components using genomic information for 2 functional traits in Italian Simmental cattle: Calving interval and lactation persistency., Alberto Cesarani; Giustino Gaspa; Yutaka Masuda; Lorenzo Degano; Daniele Vicario; Daniela A L Lourenco; Nicolò P P Macciotta, Journal of dairy science, 103, (6) 5227 - 5233,   2020年06月
Indirect predictions with a large number of genotyped animals using the algorithm for proven and young., Andre L S Garcia; Yutaka Masuda; Shogo Tsuruta; Stephen Miller; Ignacy Misztal; Daniela Lourenco, Journal of animal science, 98, (6) ,   2020年06月
Changes in genetic parameters for fitness and growth traits in pigs under genomic selection., Jorge Hidalgo; Shogo Tsuruta; Daniela Lourenco; Yutaka Masuda; Yijian Huang; Kent A Gray; Ignacy Misztal, Journal of animal science, 98, (2) ,   2020年02月
Accuracy of genomic BLUP when considering a genomic relationship matrix based on the number of the largest eigenvalues: a simulation study., Pocrnic I; Lourenco DAL; Masuda Y; Misztal I, Genetics, selection, evolution : GSE, 51, (1) ,   2019年12月
Controlling bias in genomic breeding values for young genotyped bulls., Tsuruta S; Lourenco DAL; Masuda Y; Misztal I; Lawlor TJ, Journal of dairy science, 102, (11) 9956 - 9970,   2019年11月
Single-step genome-wide association for longitudinal traits of Canadian Ayrshire, Holstein, and Jersey dairy cattle., Oliveira HR; Lourenco DAL; Masuda Y; Misztal I; Tsuruta S; Jamrozik J; Brito LF; Silva FF; Cant JP; Schenkel FS, Journal of dairy science, 102, (11) 9995 - 10011,   2019年11月
Genetic parameters for mastitis incidence and its indicators based on somatic cell score for Holsteins in Hokkaido, Japan, Yamaguchi S; Masuda Y; Nakagawa S; Abe H; Gotoh Y; Baba T; Kawahara T, Animal Science Journal, 90, (8) 915 - 923,   2019年08月
Frequentist p-values for large-scale-single step genome-wide association, with an application to birth weight in American Angus cattle., Aguilar I; Legarra A; Cardoso F; Masuda Y; Lourenco D; Misztal I, Genetics, selection, evolution : GSE, 51, (1) ,   2019年06月
A genome-wide single nucleotide polymorphism and copy number variation analysis for number of piglets born alive., Stafuzza NB; Silva RMO; Fragomeni BO; Masuda Y; Huang Y; Gray K; Lourenco DAL, BMC genomics, 20, (1) ,   2019年04月
Application of single-step genomic evaluation using multiple-trait random regression test-day models in dairy cattle., Oliveira HR; Lourenco DAL; Masuda Y; Misztal I; Tsuruta S; Jamrozik J; Brito LF; Silva FF; Schenkel FS, Journal of dairy science, 102, (3) 2365 - 2377,   2019年03月
Modeling missing pedigree in single-step genomic BLUP., Bradford HL; Masuda Y; VanRaden PM; Legarra A; Misztal I, Journal of dairy science, 102, (3) 2336 - 2346,   2019年03月
International bull evaluations by genomic BLUP with a prediction population., Fragomeni B; Masuda Y; Bradford HL; Lourenco DAL; Misztal I, Journal of dairy science, 102, (3) 2330 - 2335,   2019年03月
Modeling pedigree accuracy and uncertain parentage in single-step genomic evaluations of simulated and US Holstein datasets., Bradford HL; Masuda Y; Cole JB; Misztal I; VanRaden PM, Journal of dairy science, 102, (3) 2308 - 2318,   2019年03月
Assessing genetic architecture and signatures of selection of dual purpose Gir cattle populations using genomic information, Amanda Marchi Maiorano; Daniela Lino Lourenco; Shogo Tsuruta; Alejandra Maria Toro Ospina; Nedenia Bonvino Stafuzza; Yutaka Masuda; Anibal Eugenio Vercesi Filho; Joslaine Noely dos Santos Goncalves Cyrillo; Rogério Abdallah Curi; Josineudson Augusto II de Vasconcelos Silva, PLOS ONE, 13, (8) e0200694 - e0200694,   2018年08月02日
Differing genetic trend estimates from traditional and genomic evaluations of genotyped animals as evidence of preselection bias in US Holsteins, Masuda, Y; VanRaden, P. M; Misztal, I; Lawlor, T. J, Journal of Dairy Science, 101, (6) 5194 - 5206,   2018年06月
国内のホルスタイン集団における胚死滅および子牛致死をもたらす遺伝的不良形質のキャリア頻度, 馬場 俊見; 後藤 裕作; 山口 諭; 中川 智史; 阿部 隼人; 増田 豊; 河原 孝吉, 日本畜産学会報, 89, (2) 163 - 169,   2018年05月
Pre-selection bias and validation method in single-step GBLUP for production traits in US Holstein, Masuda, Y; VanRaden, P. M; Misztal, I; Lawlor, T. J, 11th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production (WCGALP), 11.540,   2018年02月
Application of single-step genomic best linear unbiased prediction with a multiple-lactation random regression test-day model for Japanese Holsteins, Toshimi Baba; Yusaku Gotoh; Satoshi Yamaguchi; Satoshi Nakagawa; Hayato Abe; Yutaka Masuda; Takayoshi Kawahara, ANIMAL SCIENCE JOURNAL, 88, (8) 1226 - 1231,   2017年08月
Incorporation of causative quantitative trait nucleotides in single-step GBLUP, Breno O. Fragomeni; Daniela A. L. Lourenco; Yukata Masuda; Andres Legarra; Ignacy Misztal, GENETICS SELECTION EVOLUTION, 49, (1) ,   2017年07月
Accuracy of breeding values in small genotyped populations using different sources of external information — A simulation study, Andonov, S; Lourenco; D. A. L; Fragomeni; B. O; Masuda, Y; Pocrnic, I; Tsuruta, S; Misztal, I, Journal of Dairy Science, 100, (1) 395 - 401,   2017年01月
Technical note: Avoiding the direct inversion of the numerator relationship matrix for genotyped animals in single-step genomic best linear unbiased prediction solved with the preconditioned conjugate gradient, Y. Masuda; I. Misztal; A. Legarra; S. Tsuruta; D. A. L. Lourenco; B. O. Fragomeni; I. Aguilar, JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, 95, (1) 49 - 52,   2017年01月
Effects of heat stress on production, somatic cell score and conception rate in Holsteins, Koichi Hagiya; Kiyoshi Hayasaka; Takeshi Yamazaki; Tatsuo Shirai; Takefumi Osawa; Yoshinori Terawaki; Yoshitaka Nagamine; Yutaka Masuda; Mitsuyoshi Suzuki, ANIMAL SCIENCE JOURNAL, 88, (1) 3 - 10,   2017年01月
Dimensionality of genomic information and performance of the Algorithm for Proven and Young for different livestock species, Ivan Pocrnic; Daniela A. L. Lourenco; Yutaka Masuda; Ignacy Misztal, GENETICS SELECTION EVOLUTION, 48, (1) ,   2016年10月
Sexual dimorphism in livestock species selected for economically important traits, E. M. M. van der Heide; D. A. L. Lourenco; C. Y. Chen; W. O. Herring; R. L. Sapp; D. W. Moser; S. Tsuruta; Y. Masuda; B. J. Ducro; I. Misztal, JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, 94, (9) 3684 - 3692,   2016年09月
Genetic analysis of the rates of conception using a longitudinal threshold model with random regression in dairy crossbreeding within a tropical environment, Sayan Buaban; Keigo Kuchida; Mitsuyoshi Suzuki; Yutaka Masuda; Wuttigrai Boonkum; Monchai Duangjinda, ANIMAL SCIENCE JOURNAL, 87, (8) 961 - 971,   2016年08月
Genetic relationships of fertility traits with test-day milk yield and fat-to-protein ratio in tropical smallholder dairy farms, Sayan Buaban; Monchai Duangjinda; Mitsuyoshi Suzuki; Yutaka Masuda; Jureeratn Sanpote; Keigo Kuchida, ANIMAL SCIENCE JOURNAL, 87, (5) 627 - 637,   2016年05月
The Dimensionality of Genomic Information and Its Effect on Genomic Prediction, Ivan Pocrnic; Daniela A. L. Lourenco; Yutaka Masuda; Andres Legarra; Ignacy Misztal, GENETICS, 203, (1) 573 - 581,   2016年05月
Implementation of genomic recursions in single-step genomic best linear unbiased predictor for US Holsteins with a large number of genotyped animals, Y. Masuda; I. Misztal; S. Tsuruta; A. Legarra; I. Aguilar; D. A. L. Lourenco; B. O. Fragomeni; T. J. Lawlor, JOURNAL OF DAIRY SCIENCE, 99, (3) 1968 - 1974,   2016年03月
Technical note: Acceleration of sparse operations for average-information REML analyses with supernodal methods and sparse-storage refinements, Y. Masuda; I. Aguilar; S. Tsuruta; I. Misztal, JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, 93, (10) 4670 - 4674,   2015年10月
Use of genomic recursions and algorithm for proven and young animals for single-step genomic BLUP analyses – a simulation study, B. O. Fragomeni; D. A. L. Lourenco; S. Tsuruta; Y. Masuda; I. Aguilar; I. Misztal, Journal of Animal Breeding and Genetics, 132, (5) 340 - 345,   2015年10月
Short communication: Genetic analysis for fertility traits of heifers and cows from smallholder dairy farms in a tropical environment, S. Buaban; M. Duangjinda; M. Suzuki; Y. Masuda; J. Sanpote; K. Kuchida, JOURNAL OF DAIRY SCIENCE, 98, (7) 4990 - 4998,   2015年07月
Hot topic: Use of genomic recursions in single-step genomic best linear unbiased predictor (BLUP) with a large number of genotypes, B. O. Fragomeni; D. A. L. Lourenco; S. Tsuruta; Y. Masuda; I. Aguilar; A. Legarra; T. J. Lawlor; I. Misztal, JOURNAL OF DAIRY SCIENCE, 98, (6) 4090 - 4094,   2015年06月
Genetic evaluation using single-step genomic best linear unbiased predictor in American Angus, D. A. L. Lourenco; S. Tsuruta; B. O. Fragomeni; Y. Masuda; I. Aguilar; A. Legarra; J. K. Bertrand; T. S. Amen; L. Wang; D. W. Moser; I. Misztal, JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, 93, (6) 2653 - 2662,   2015年06月
北海道のホルスタイン集団における体細胞スコアの遺伝評価モデルの検討, 山口諭; 増田豊; 中川智史; 後藤裕作; 阿部隼人; 馬場俊見; 河原孝吉; 鈴木三義, 日本畜産学会報, Japanese Society of Animal Science, 86, (2) 153 - 164,   2015年05月
Genetic analysis of twinning rate and milk yield using a threshold-linear model in Japanese Holsteins, Yutaka Masuda; Toshimi Baba; Mitsuyoshi Suzuki, ANIMAL SCIENCE JOURNAL, 86, (1) 31 - 36,   2015年01月
Application of supernodal sparse factorization and inversion to the estimation of (co) variance components by residual maximum likelihood, Y. Masuda; T. Baba; M. Suzuki, JOURNAL OF ANIMAL BREEDING AND GENETICS, 131, (3) 227 - 236,   2014年06月
多形質アニマルモデルによるホルスタイン種雄牛の受胎率に関する推定育種価の信頼性, 萩谷功一; 大澤剛史; 白井達夫; 寺脇良悟; 山崎武志; 長嶺慶隆; 伊藤文彰; 河原孝吉; 増田豊; 鈴木三義, 日本畜産学会報, (公社)日本畜産学会, 85, (2) 131 - 138,   2014年05月
Genetic correlations between production and disease traits during first lactation in Holstein cows, K. Hagiya; T. Yamazaki; Y. Nagamine; K. Togashi; S. Yamaguchi; Y. Gotoh; T. Kawahara; Y. Masuda; M. Suzuki, ANIMAL, 8, (2) 217 - 223,   2014年02月
農用馬の体重ならびに体尺測定値に関する異なる成長段階における遺伝的パラメータの推定, 増田 豊; 久保 喜広; 山下 大輔; 柏村 文郎; 鈴木 三義, 日本畜産学会報, 日本畜産学会, 85, (1) 1 - 12,   2014年02月
Relationships between conception rate in Holstein heifers and cows and milk yield at various stages of lactation, K. Hagiya; Y. Terawaki; T. Yamazaki; Y. Nagamine; F. Itoh; S. Yamaguchi; H. Abe; Y. Gotoh; T. Kawahara; Y. Masuda; M. Suzuki, ANIMAL, 7, (9) 1423 - 1428,   2013年09月
多形質モデルによる在群性の育種価推定のために最適な形質の組み合わせ, 萩谷 功一; 大澤 剛史; 増田 豊; 鈴木 三義; 山崎 武志; 長嶺 慶隆; 富樫 研治, 日本畜産学会報, (公社)日本畜産学会, 83, (2) 117 - 123,   2012年05月
乳牛の双子率に対する表型および遺伝的要因, 馬場 俊見; 金子 瞳; 増田 豊; 鈴木 三義, 日本畜産学会報, 日本畜産学会, 83, (2) 125 - 132,   2012年05月
ホルスタイン種における在群期間と泌乳・体型形質間の遺伝相関の年代的な変化, 萩谷 功一; 大澤 剛史; 増田 豊; 鈴木 三義; 山崎 武志; 富樫 研治, 日本畜産学会報, (公社)日本畜産学会, 83, (1) 9 - 19,   2012年02月
交雑種の枝肉格付形質に対する種雄牛×母の品種による交互作用の検討, 中橋良信; 増田 豊; 口田圭吾, 日本畜産学会報, 日本畜産学会, 83, (1) 21 - 28,   2012年02月
黒毛和種におけるロース芯内交雑脂肪の脂肪酸組成に関する遺伝的パラメータの推定, 中橋良信; 由佐哲朗; 増田 豊; 日高 智; 口田圭吾, 日本畜産学会報, 日本畜産学会, 83, (1) 29 - 34,   2012年02月
乳用牛の泌乳持続性に対する遺伝評価モデルの比較, 増田 豊; 鈴木 三義, 日本畜産学会報, Japanese Society of Animal Science, 82, (3) 297 - 304,   2011年08月
Selecting the desirable method for predicting 305-day lactation yields in Mongolia, Gelegjamts Naranchuluum; Hiroko Ohmiya; Yutaka Masuda; Kouichi Hagiya; Mitsuyoshi Suzuki, ANIMAL SCIENCE JOURNAL, 82, (3) 383 - 389,   2011年03月
乳牛の飼養形態間および種雄牛の国籍間における遺伝と環境の交互作用, 馬場 俊見; 清水 知佳; 橋本 優子; 増田 豊; 鈴木 三義, 日本畜産学会報, 社団法人日本畜産学会, 82, (1) 1 - 7,   2011年02月
Relationships Between the First Ovulation Postpartum and Polymorphism in Genes Relating to Function of Immunity, Metabolism and Reproduction in High-producing Dairy Cows, Koumei Shirasuna; Chiho Kawashima; Chiaki Murayama; Yuka Aoki; Yutaka Masuda; Katsuya Kida; Motozumi Matsui; Takashi Shimizu; Akio Miyamoto, JOURNAL OF REPRODUCTION AND DEVELOPMENT, 57, (1) 135 - 142,   2011年02月
多形質予測法による乳期途中経過記録からの305日乳生産量の予測, 山口 諭; 河原 孝吉; 後藤 裕作; 中川 智史; 増田 豊; 鈴木 三義, 日本畜産学会報, 社団法人日本畜産学会, 81, (4) 401 - 412,   2010年11月
ホルスタインにおける縦断2値データを使用した雌牛の受胎率に影響する遺伝的および環境的要因, 河原 孝吉; 後藤 裕作; 増田 豊; 山口 諭; 鈴木 三義, 日本畜産学会報, 社団法人日本畜産学会, 81, (2) 121 - 132,   2010年05月
Relationships between reproductive traits of heifers and cows and yield traits for Holsteins in Japan, H. Abe; Y. Masuda; M. Suzuki, JOURNAL OF DAIRY SCIENCE, 92, (8) 4055 - 4062,   2009年08月
北海道のホルスタイン種における初産分娩月齢と繁殖ならびに生産形質との遺伝的関連, 阿部 隼人; 増田 豊; 鈴木 三義, 日本畜産学会報, 日本畜産学会, 79, (2) 203 - 209,   2008年05月
乳牛の各泌乳ステージにおける検定日乳量に影響を及ぼす諸要因の検討, 増田 豊; 鈴木 三義, 日本畜産學會報 = The Japanese journal of zootechnical science, 社団法人日本畜産学会, 79, (1) 9 - 18,   2008年02月
ホルスタイン集団における最適な泌乳曲線モデルの検討, 山口 諭; 河原 孝吉; 後藤 裕作; 増田 豊; 鈴木 三義, 日本畜産學會報 = The Japanese journal of zootechnical science, 社団法人日本畜産学会, 78, (4) 415 - 425,   2007年11月
Short communication: A positive relationship between the first ovulation postpartum and the increasing ratio of milk yield in the first part of lactation in dairy cows, C. Kawashima; C. Amaya Montoya; Y. Masuda; E. Kaneko; M. Matsui; T. Shimizu; N. Matsunaga; K. Kida; Y. -I. Miyake; M. Suzuki; A. Miyamoto, JOURNAL OF DAIRY SCIENCE, 90, (5) 2279 - 2282,   2007年05月

書籍等出版物

乳牛改良で生産性向上, 寺脇良悟監修, 第3章, デーリィマン社,   2016年10月, 9784864530415
乳牛管理の基礎と応用 2012年改訂版, 柏村文郎; 古村圭子; 増子孝義監修; 口絵; 古村 圭子; 柏村文郎; 古村圭子; 増子孝義, 第9章第2節, デーリィ・ジャパン社,   2012年04月, 4924506621
徹底・後継牛づくり, 柏村文郎; 鈴木三義監修, I章 6. 新たな遺伝標識を活用した後継牛づくりの実践と可能性, デーリィマン社,   2010年10月, 9784938445942
新時代の乳牛改良, 鈴木三義; 寺脇良悟監修, 第4章 乳牛の健康・作業性・成熟度の改良, 酪農学園大学エクステンションセンター,   2009年03月, 9784902786101

講演・口頭発表等

ホルスタインの泌乳前期における乳中脂肪酸組成と泌乳形質との遺伝相関, 山本 直樹; 増田 豊, 北海道畜産草地学会 第12回学会大会
乳用牛群におけるゲノミックヤングサイアの利用に関するリスク評価, 増田 豊, 北海道畜産草地学会 第12回学会大会
北海道のホルスタイン集団における乳中脂肪酸組成の泌乳曲線, 山本 直樹; 増田 豊, 日本畜産学会第131回大会
北海道のホルスタインにおける 乳中脂肪酸組成に関する3産次 までの遺伝的パラメータの推定, 増田 豊, 日本畜産学会第131回大会
Genetic parameters for the composition of milk fatty acid of Holsteins, Yutaka Masuda, The 74th EAAP Annual Meeting
Environmental factors and genetic parameters for milk fatty acids in Japanese Holstein cattle, Yutaka Masuda, American Dairy Science Association 2023 Annual Meeting
SNP情報のゲノミック評価以外の活用法, 増田 豊, 令和4年度ゲノミック評価手法普及・啓発セミナー 第2部, 畜産技術協会
ゲノミック評価に関する世界情勢と研究動向, 増田 豊, 令和4年度ゲノミック評価手法普及・啓発セミナー 第1部, 畜産技術協会
ヤングサイアを活用した我が国の乳用牛改良の加速化, 増田 豊, JAAB勉強会
Challenges, opportunities and direction for dairy-cattle genetic improvement in Thailand, Yutaka Masuda, The role and importance of dairy genetic improvement in the development of Thai dairy-cattle industry under Thailand-FAO CPF.
乳用牛の初産記録に基づく選抜が泌乳成熟曲線の遺伝的トレンドに及ぼす影響, 増田 豊, 日本畜産学会第130回大会
An iterative method for de-regressed proof in single-step genomic BLUP and its application to a dairy cattle population, Yutaka Masuda, The 12th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production (WCGALP)
家畜におけるゲノミック選抜の現状と展望, 増田 豊, 酪農学園大学・雪印種苗株式会社 共催酪農セミナー
北米の肉用牛と乳用牛の育種改良の現状, 増田 豊, 十勝AI協会研修会
畜産における ゲノム育種の現状と課題, 増田 豊, 日本動物遺伝育種学会 第22回大会 シンポジウム
アメリカ(北米)における育種改良の実状, 増田 豊, 令和3(2021)年度 石狩家畜人工授精師協会研修会
乳用牛における泌乳量の成熟度の遺伝的トレンド, 増田 豊, 日本畜産学会第129回大会
家畜とくに乳用牛の遺伝・育種におけるSDGsに向けた取り組み, 増田 豊, 北海道畜産草地学会 第10回大会シンポジウム
Unknown-parent group and metafounder models for missing pedigree in ssGBLUP, 増田 豊, The 72nd EAAP Annual Meeting
Preliminary results on de-regressed proof in single-step GBLUP, 増田 豊, ICAR/Interbull Virtual Conference 2021
Genomic prediction with single-step genomic BLUP using a subset of genotypes in US Holstein, 増田 豊, The 71st EAAP Annual Meeting
Genomic prediction with single-step genomic BLUP using a subset of genotypes in US Holstein, 増田 豊, American Dairy Science Association (ADSA) Virtual Annual Meeting
Genomic prediction with missing pedigrees in single-step GBLUP in a large-scale genotyped population, 増田 豊, 日本畜産学会第126回大会
Genomic prediction with missing pedigrees in single-step GBLUP for production traits in US Holstein, 増田 豊, The 70th EAAP Annual Meeting
Efficient quality control methods for genomic and pedigree data used in routine genomic evaluation, 増田 豊, ASAS-CSAS Annual Meeting and Trade Show
Genomic prediction with unknown-parent groups and metafounders for production traits in US Holsteins, 増田 豊, American Dairy Science Association (ADSA) Annual Meeting
Single-step GBLUP including more than 2 million genotypes with missing pedigrees for production traits in US Holstein, 増田 豊, 2019 Interbull Annual Meeting
Alternative covariance structures including unknown-parent groups and metafounders in single-step genomic BLUP, 増田 豊, Gordon Research Conference Quantitative Genetics and Genomics
Genomic predictability of single-step GBLUP for production traits in US Holstein, 増田 豊, The 69th EAAP Annual Meeting
Genomic predictability of single-step GBLUP for production traits in US Holstein., 増田 豊, ADSA 2018 Annual Meeting
Pre-selection bias and validation method in single-step GBLUP for production traits in US Holstein, 増田 豊, 11th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production (WCGALP)
Including causative variants into single step genomic BLUP., B. D. Fragomeni; D. A. L. Lourenco; Y. Masuda; A. Legarra; I. Misztal, JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, AMER SOC ANIMAL SCIENCE
Genetic trends from single-step GBLUP and traditional BLUP for production traits in US Holstein, 増田 豊, ADSA 2017 Annual Meeting
Selected inversion in quantitative genetics. In MS78: Selected inversion and its application, 増田 豊, SIAM Conference on Computational Science & Engineering (CSE17)
Tests of single-step GBLUP for production traits in US Holsteins, 増田 豊, Interbull Technical Workshop 2017
Single-step GBLUP using APY inverse for protein yield in US Holstein with a large number of genotyped animals, 増田 豊, The 67th EAAP Annual Meeting
Single-step GBLUP using APY inverse for protein yield in US Holstein with a large number of genotyped animals, 増田 豊, ASAS & ADSA Joint Annual Meeting (JAM) 2016, Salt Lake City, UT (USA), July 19-23, 2016
Genomic predictions with approximated G-inverse for a large genotyped population, 増田 豊, The 66th EAAP Annual Meeting, Warsaw (Poland), August 31 to September 4, 2015
Genomic predictions with APY G-inverse for a large number of genotyped animals, 増田 豊, ASAS & ADSA Joint Annual Meeting (JAM) 2015, Orlando, FL (USA), July 12-16, 2015
Single-step evaluation in the US Holstein population with 570k genotyped animals, 増田 豊, Interbull Annual Meeting 2015, Orlando, FL (USA), July 9-11, 2015
Acceleration of computations in AI REML for single-step GBLUP models, 増田 豊, 10th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Vancouver (Canada), August 17-22, 2014
Advantage of supernodal methods in REMLwhen dense matrices are involved in a coefficient matrix of mixed model equations, 増田 豊, ASAS & ADSA Joint Annual Meeting (JAM) 2014, Kansas City, MO (USA), July 20-24, 2014
ホルスタイン種の多産次変量回帰検定日モデルによる泌乳形質および泌乳持続性の遺伝的パラメータの推定, 大澤剛史; 萩谷功一; 増田豊; 鈴木三義, 日本畜産学会大会講演要旨
泌乳形質および受胎率に関する異なる暑熱環境間の遺伝相関, 萩谷功一; 早坂貴代史; 山崎武志; 白井達夫; 大澤剛史; 寺脇良悟; 長嶺慶隆; 増田豊; 鈴木三義, 日本畜産学会大会講演要旨
Efficient inversion of a large genomic relationship matrix stored on a disk using a CPU & GPUs, 増田 豊, ASAS & ADSA Joint Annual Meeting (JAM) 2013, Indianapolis, IN (USA), July 8-12, 2013
ホルスタイン種の受胎率に関する推定育種価の信頼性, 萩谷功一; 大澤剛史; 白井達夫; 寺脇良悟; 山崎武志; 長嶺慶隆; 伊藤文彰; 河原孝吉; 増田豊; 鈴木三義, 日本畜産学会大会講演要旨
乳用牛の牛群曲線を考慮した多産次変量回帰検定日モデルの検討, 大澤剛史; 萩谷功一; 増田豊; 鈴木三義, 日本畜産学会大会講演要旨
Sparse structures for mixed model equations (MME) for different animal models., 増田 豊, The 63rd EAAP Annual Meeting, Bratislava (Slovakia), August 27-31, 2012
多形質モデルによる在群性の育種価推定のために最適な形質の組み合わせ, 萩谷功一; 大澤剛史; 増田豊; 鈴木三義; 山崎武志; 長嶺慶隆; 富樫研治, 日本畜産学会大会講演要旨, 公益社団法人 日本畜産学会, 多形質線形モデルを使用し,在群期間に関する遺伝的能力の推定のために用いる形質における最適な組み合わせについて検討した.データは,2001年と2002年に生まれた75,091個体における初産次の乳量,体細胞スコア,体型(肢蹄,胸の幅,鋭角性,尻の角度,蹄の角度,後乳房の高さ,乳房の懸垂,乳房の深さ,前乳頭の配置)の合計12形質の記録および血縁情報である.在群期間は,最大84ヵ月齢までの除籍月齢を表した打ち切り記録である.母数効果は,牛群・年次,初産分娩月齢(在群期間),牛群・年次,分娩月,分娩月齢(乳量および体細胞スコア),牛群・審査員・審査日,初産審査月齢,泌乳ステージ(体型)を考慮した.在群期間の遺伝的能力推定のために採用する形質数を合計9形質としたとき,在群期間,乳量,体細胞スコア,肢蹄,胸の幅,鋭角性,乳房の懸垂,乳房の深さおよび前乳頭の配置を含めた場合,種雄牛に関する在群期間評価値の信頼度が最大であった.
乳用牛におけるゲノミック選抜の 応用と課題, 増田 豊, 第49回家畜育種研究会談話会
制限付き最尤法による分散成分の推定における現代的な疎行列技法の応用, 増田 豊, 日本畜産学会第115回大会
Genetic relationships among metabolic profile components, body condition score, persistency of lactation and milk yield in holstein cattle, 増田 豊, 9th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Leipzig (Germany), August 1-6, 2010
乳用牛の加齢による乳量の分散の変動を説明するモデルに関する検討, 萩谷功一; 大澤剛史; 増田豊; 鈴木三義, 日本畜産学会大会講演要旨
泌乳持続性と分娩間隔との遺伝的関連性, 萩谷功一; 富樫研治; 武田尚人; 山崎武志; 白井達夫; 佐分淳一; 増田豊; 鈴木三義, 日本畜産学会大会講演要旨
Estimation of genetic and phenotypic parameters for days open and test day milk yields in Japanese Holsteins, Y. Masuda; H. Abe; M. Suzuki, JOURNAL OF DAIRY SCIENCE, AMER DAIRY SCIENCE ASSOC
Phenotypic and genetic analysis of days open for Japanese Holstein cows, H. Abe; M. Suzuki; Y. Masuda, JOURNAL OF DAIRY SCIENCE, AMER DAIRY SCIENCE ASSOC
Estimation of genetic and phenotypic parameters for days open and test day milk yields in Japanese Holsteins, Y. Masuda; H. Abe; M. Suzuki, JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, AMER SOC ANIMAL SCIENCE
Phenotypic and genetic analysis of days open for Japanese Holstein cows, H. Abe; M. Suzuki; Y. Masuda, JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, AMER SOC ANIMAL SCIENCE
ホルスタイン種における泌乳持続性に関する遺伝的パラメータの推定, 萩谷功一; 富樫研治; 武田尚人; 山崎武志; 白井達夫; 佐分淳一; 増田豊; 鈴木三義, 日本畜産学会大会講演要旨
The first ovulation of dominant follicle within three weeks postpartum closely relates to metabolic status and peak milk yield in high-producing dairy cows., A. Miyamoto; M. Kataoka; Y. Masuda; C. Kawashima; E. Kaneko; N. Matsunaga; M. Matsui; M. Ishii; K. Kida; Y. -I. Miyake; M. Suzuki, JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, AMER SOC ANIMAL SCIENCE
Estimation of genetic parameters for maturity of lactation in Japanese Holsteins., Y. Masuda; M. Suzuki, JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, AMER SOC ANIMAL SCIENCE

MISC

牛におけるゲノミック選抜法の積極的な活用 第4回 ゲノミック選抜の活用戦略, 増田 豊, 繁殖技術, 43, (2) 41 - 44,   2023年03月
牛におけるゲノミック選抜法の積極的な活用 第3回 ゲノミック育種価の信頼度と最適な種雄牛選択, 増田 豊, 繁殖技術, 42, (5) 123 - 129,   2022年09月
牛におけるゲノミック評価における抗病性, 増田 豊, 臨床獣医, 40, (8) 30 - 34,   2022年07月
Investigating genetic redundancy as a source of genetic diversity and adaptability in the U.S. Holstein breed, Steyn, Y; Lawlor, T.J; Tsuruta, S; Masuda, Y; Legarra, A; Lourenco, D.A.L; Misztal, I, Proceedings of the 12th World Congress of Genetics Applied to Livestock Production,   2022年07月
Population structure of U.S. Holsteins allows for a snapshot of allele frequency changes and family specific SNPs, Lawlor, T.J; Steyn, Y; Tsuruta, S; Masuda, Y; Lourenco, D.A.L; Misztal, I, Proceedings of the 12th World Congress of Genetics Applied to Livestock Production,   2022年07月
How ssGBLUP became suitable for national dairy cattle evaluations, Misztal, I; Lourenco, D; Tsuruta, S; Aguilar, I; Masuda, Y; Bermann, M; Cesarani, A; Legarra, A, Proceedings of the 12th World Congress of Genetics Applied to Livestock Production,   2022年07月
Recent updates in the BLUPF90 software suite, Lourenco, D; Tsuruta, S; Aguilar, I; Masuda, Y; Bermann, M; Legarra, A; Misztal, I, Proceedings of the 12th World Congress of Genetics Applied to Livestock Production, 36_012,   2022年07月
A deregression method for a single-step SNP BLUP model using all genotype data, Z Liu; Y Masuda, Proceedings of the 12th World Congress of Genetics Applied to Livestock Production,   2022年07月
An alternative method to consider a reference population in Single-Step SNP BLUP model without separating genomic terms, Osawa, T; Baba, T; Masuda, Y; Kawahara, T; Goto, Y, Proceedings of the 12th World Congress of Genetics Applied to Livestock Production,   2022年07月
牛におけるゲノミック選抜法の積極的な活用 第2回 DNA情報を用いる選抜法, 増田 豊, 繁殖技術, 42, (3) 89 - 94,   2022年07月
Genomic prediction of milk-production traits in Thai dairy cattle, Pattarapol Sumreddee; Sayan Buaban; Somsak Prempree; Kiettisak Lengnudum; Jatuporn Pongpeng; Korbsook Thongsodsaeng; Monchai Duangjinda; Praopilas Phakdeedindan; Yutaka Masuda, 2022 Current trends of livestock research in Taiwan and Southeast Asian Countries Organized by Department of Animal Science, National Chung Hsing University, Taiwan June 29 – July 1, 2022 (online),   2022年06月
牛におけるゲノミック選抜法の積極的な活用 第1回 従来選抜法の問題とゲノミック選抜法への期待, 増田 豊, 繁殖技術, 42, (3) 53 - 58,   2022年05月
牛群サイズまたは繁殖成績が上位の乳用牛群記録に基づく推定育種価の精度の検証, 山崎武志; 大澤剛史; 増田豊, 日本畜産学会大会講演要旨, 130th,   2022年
A deregression method for single-step genomic model using all genotype data, Zengting Liu; Yutaka Masuda, Interbull Bulletin, 56,   2021年09月
Deregression formula for single-step genomic BLUP, Yutaka Masuda; Zengting Liu; Peter Sullivan, Interbull Bulletin, 56,   2021年09月, https://journal.interbull.org/index.php/ib/article/view/71
Studies on inflation of GEBV in single-step GBLUP for type, I. Misztal; H. L. Bradford; D. A. L. Lourenco; S. Tsuruta; Y. Masuda; A. Legarra; T. J. Lawlor, Interbull Bulletin, 51,   2017年09月
Including causative variants into single step genomic BLUP., B. D. Fragomeni; D. A. L. Lourenco; Y. Masuda; A. Legarra; I. Misztal, JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, 95,   2017年08月, 10.2527/asasann.2017.193
Direct and indirect genomic evaluations in beef cattle, D. A. L. Lourenco; I. Misztal; S. Tsuruta; B. O. Fragomeni; I. Aguilar; Y. Masuda; D. Moser, Interbull Bulletin, 49,   2015年08月
Single-step genomic evaluations with 570K genotyped animals in US Holsteins, Y. Masuda; I. Misztal; S. Tsuruta; D. A. L. Lourenco; B. O. Fragomeni; A. Legarra; I. Aguilar; T. J. Lawlor, Interbull Bulletin, 49,   2015年08月
Efficient inversion of genomic relationship matrix by the algorithm for proven and young (APY), I. Misztal; B. O. Fragomeni; D. A. L. Lourenco; S. Tsuruta; Y. Masuda; I. Aguilar; A. Legarra; T. Lawlor, Interbull Bulletin, 49,   2015年08月
ホルスタイン種の多産次変量回帰検定日モデルによる泌乳形質および泌乳持続性の遺伝的パラメータの推定, 大澤剛史; 萩谷功一; 増田豊; 鈴木三義, 日本畜産学会大会講演要旨, 118th,   2014年03月27日
泌乳形質および受胎率に関する異なる暑熱環境間の遺伝相関, 萩谷功一; 早坂貴代史; 山崎武志; 白井達夫; 大澤剛史; 寺脇良悟; 長嶺慶隆; 増田豊; 鈴木三義, 日本畜産学会大会講演要旨, 117th,   2013年09月09日
各泌乳ステージにおける乳量と受胎率間の遺伝的関係, 萩谷功一; 寺脇良悟; 山崎武志; 長嶺慶隆; 伊藤文彰; 山口諭; 阿部隼人; 後藤裕作; 河原孝吉; 増田豊; 鈴木三義, 北海道畜産草地学会報, 1,   2013年03月29日
乳用牛の牛群曲線を考慮した多産次変量回帰検定日モデルの検討, 大澤剛史; 萩谷功一; 増田豊; 鈴木三義, 日本畜産学会大会講演要旨, 116th,   2013年03月28日
ホルスタイン種の受胎率に関する推定育種価の信頼性, 萩谷功一; 大澤剛史; 白井達夫; 寺脇良悟; 山崎武志; 長嶺慶隆; 伊藤文彰; 河原孝吉; 増田豊; 鈴木三義, 日本畜産学会大会講演要旨, 116th,   2013年03月28日
多形質モデルによる在群性の育種価推定のために最適な形質の組み合わせ, 萩谷功一; 大澤剛史; 増田豊; 鈴木三義; 山崎武志; 長嶺慶隆; 富樫研治, 日本畜産学会大会講演要旨, 115th, (2) 159 - 123,   2012年03月28日
酪農現場での種雄牛の選定における問題点の解明, 橋本 優子; 馬場 俊見; 増田 豊; 鈴木 三義, 繁殖技術, 30, (2) 23 - 26,   2010年09月
ゲノム解析と乳牛改良 ゲノミック評価について, 増田 豊, 家畜人工授精, (259) 1 - 6,   2010年07月
乳用牛の加齢による乳量の分散の変動を説明するモデルに関する検討, 萩谷功一; 大澤剛史; 増田豊; 鈴木三義, 日本畜産学会大会講演要旨, 111th,   2009年09月28日
泌乳持続性と分娩間隔との遺伝的関連性, 萩谷功一; 富樫研治; 武田尚人; 山崎武志; 白井達夫; 佐分淳一; 増田豊; 鈴木三義, 日本畜産学会大会講演要旨, 107th,   2007年03月27日
Phenotypic and genetic analysis of days open for Japanese Holstein cows, H. Abe; M. Suzuki; Y. Masuda, JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, 85,   2007年
Estimation of genetic and phenotypic parameters for days open and test day milk yields in Japanese Holsteins, Y. Masuda; H. Abe; M. Suzuki, JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, 85,   2007年
Phenotypic and genetic analysis of days open for Japanese Holstein cows, H. Abe; M. Suzuki; Y. Masuda, JOURNAL OF DAIRY SCIENCE, 90,   2007年
Estimation of genetic and phenotypic parameters for days open and test day milk yields in Japanese Holsteins, Y. Masuda; H. Abe; M. Suzuki, JOURNAL OF DAIRY SCIENCE, 90,   2007年
ホルスタイン種における泌乳持続性に関する遺伝的パラメータの推定, 萩谷功一; 富樫研治; 武田尚人; 山崎武志; 白井達夫; 佐分淳一; 増田豊; 鈴木三義, 日本畜産学会大会講演要旨, 106th,   2006年03月20日
Estimation of genetic parameters for maturity of lactation in Japanese Holsteins., Y. Masuda; M. Suzuki, JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, 84,   2006年
The first ovulation of dominant follicle within three weeks postpartum closely relates to metabolic status and peak milk yield in high-producing dairy cows., A. Miyamoto; M. Kataoka; Y. Masuda; C. Kawashima; E. Kaneko; N. Matsunaga; M. Matsui; M. Ishii; K. Kida; Y. -I. Miyake; M. Suzuki, JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, 84,   2006年
Estimation of genetic parameters and breeding values for persistency of lactation in Japanese Holsteins, Y. Masuda; M. Suzuki, JOURNAL OF DAIRY SCIENCE, 88,   2005年
Estimation of genetic parameters and breeding values for persistency of lactation in Japanese Holsteins, Y. Masuda; M. Suzuki, JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, 83,   2005年

受賞

  2021年04月, 日本畜産学会, Excellent Paper Award (Animal Science Journal), Effects of heat stress on production, somatic cell score and conception rate in Holsteins

競争的資金

日本学術振興会, 科学研究費助成事業 基盤研究(C), 乳中脂肪酸組成におけるゲノムと飼養環境との相互作用の解明とゲノミック選抜への応用, 20220401, 20250331, 増田 豊
全国競馬・畜産振興会, 全国競馬・畜産振興会畜産振興事業, 乳用牛の泌乳前期健全性改善指標開発事業, 202205, 202503
日本学術振興会, 科学研究費助成事業 研究活動スタート支援, 仮親を伴うシングル・ステップ法における育種価予測値のバイアス発生メカニズムの解明, 202108, 202503, 増田 豊, シングルステップ法は、観測データ、血縁関係、ゲノム情報を結びつけることで個々の育種価を予測し、特に情報量の少ない若齢個体の選抜の正確度を向上させるゲノミック選抜手法である。血縁情報はしばしば欠損するため、血統表の不明親に「仮親」を割り当て、育種価予測値の偏りを軽減するモデルが提案されている。本研究の目的は、血縁関係に欠損がある場合に、情報量の欠落に応じて育種価予測値がどのように偏るかを調査し、偏りの少ない最適な仮親モデルを提案することを目指す。 初年度である本年度は、シミュレーションにより、血縁にさまざまな欠損パターンをもつ疑似データを生成した。本研究の目的に沿ったデータを生成するため、既存のシミュレーションプログラムを修正した。そのシミュレーションは、乳用牛の繁殖構造を模したものであった。1頭の種雄牛が多数の後代牛を持ち、その後代牛(雌牛)が複数の群にまたがって飼養されていた。生成された直後のデータには血統情報の欠落がなかったが、事後的に母方の血縁情報を欠損させた。欠損のパターンとして、ランダムに血縁が欠損する状況、特定の種雄牛の後代に欠損が集中する状況、遺伝的能力の低い後代に欠損が集中する状況を想定した。ゲノム情報を用いないアニマルモデルBLUP法による遺伝能力評価を行うと、仮親を用いない場合には、いずれの欠損パターンにおいても遺伝的トレンドの過小推定がみられたが、その程度は欠損の程度に依存した。仮親を含めると、遺伝的トレンドは真値に近づいたが、仮親のもつ個体数が十分ではない場合にはバイアスを除去できなかった。
乗用馬ならびに農用馬の遺伝的改良に関する研究, 201004
乳牛におけるゲノミック選抜(genomic selection)の応用, 2009, 密なSNPマーカーを用いて乳用牛の遺伝能力評価を行う際の,最適な育種計画,手法および検証方法について検討する。
家畜の量的形質に対する変量回帰(random regression)分析の応用, 2008
genetic improvement of life time production performance for dairy cattle, 2005, 2007
乳用牛の生涯生産能力に関する遺伝的改善, 2005

社会貢献活動情報

社会貢献活動

  2024年01月18日, 乳牛の改良と牛群検定, 令和5年度 酪農ヘルパー初級者養成研修カリキュラム
  2023年01月19日, 乳牛の改良と牛群検定, 令和4年度 酪農ヘルパー中級者養成研修カリキュラム


教員総覧